Határok A magas zsírtartalmú étrend különböző forrásai jelentős változásokat idéznek elő az óvoda bélmikrobiotájában

Élelmiszer mikrobiológia

Szerkesztette
Javier Carballo

Vigo Egyetem, Spanyolország

Felülvizsgálta
Tarique Hussain

Nukleáris Mezőgazdasági és Biológiai Intézet, Pakisztán

Guuan irányítása

Hunan Mezőgazdasági Egyetem, Kína

A szerkesztő és a lektorok kapcsolatai a legfrissebbek a Loop kutatási profiljukban, és nem feltétlenül tükrözik a felülvizsgálat idején fennálló helyzetüket.

magas

  • Cikk letöltése
    • PDF letöltése
    • ReadCube
    • EPUB
    • XML (NLM)
    • Kiegészítő
      Anyag
  • Exportálás
    • EndNote
    • Referencia menedzser
    • Egyszerű TEXT fájl
    • BibTex
OSZD MEG

Eredeti kutatás CIKK

  • 1 Guangdong tartományi állat-táplálkozás-ellenőrző laboratórium, Állattudományi Főiskola, Dél-Kínai Mezőgazdasági Egyetem, Guangzhou, Kína
  • 2 Állattudományi Főiskola és Nemzeti Sertéstenyésztési Kutatóközpont, Dél-Kínai Mezőgazdasági Egyetem, Guangzhou, Kína

Bioinformatikai elemzés

A nyers szekvenciaadatokat a QIIME (Ver. 1.7.0) szoftvercsomaggal (Campbell és mtsai, 2010) vágtuk, szűrtük, igazítottuk és osztályoztuk. Az alappár leolvasását minden olyan helyen megcsonkítottuk, ahol az átlagos minőségi pontszám 1 volt, és a kimérákat eltávolítottuk, hogy megkapjuk a hatékony címkéket (Edgar et al., 2011). Az operatív taxonómiai egységeket (OTU-k) az átlagos szomszédos algoritmus segítségével csoportosítottuk 97% -os hasonlósággal, az UPARSE (Ver. 7.0.1001) 2 felhasználásával. Ezután az egyes OTU-k reprezentatív szekvenciáit a taxonokhoz rendeltük a QIIME 3 és a Ribosomal Database Project (RDA) osztályozó algoritmus (Cole és mtsai, 2009) alapján, a Silva 4 adatbázis alapján, 80% -os megbízhatósági szinten. Az alfa sokféleséget, például a fajgazdagság becslőt (Chao1 és ACE) és a diverzitás indexeket (Shannon és Simpson) a MOTHUR alkalmazásával számítottuk ki (Schloss et al., 2009). Súlyozatlan Unifrac távolság-alapú fő koordináta-analízist (PCoA), amely OTU-kon alapul, és molekuláris variancia-elemzést (AMOVA) végeztek, hogy áttekintést nyújtsanak a kezelésekre adott mikrobiális válaszról.

Az ebben a cikkben szereplő 16S-szekvencia információkat a GenBank Sequence Read Archive adatbázisban rakták le SRP226668 csatlakozási szám alatt.

Korrelációs elemzés

Korábbi vizsgálatunkban a zsírtípusok jelentősen befolyásolták a növekedési teljesítményt és a tápanyagok hasznosulását (Yang et al., 2018). Az EPO-val táplált sertések száma megnőtt ( 0,5 és 0,5 és ∗ ∗∗ Kulcsszavak: zsírtípus, bél, mikrobiális közösség, emészthetőség, óvodai sertések

Idézet: Yang F, Zhang S, Tian M, Chen J, Chen F és Guan W (2020) A magas zsírtartalmú étrend különböző forrásai markáns változásokat idéznek elő az óvodai sertések bélmikrobiotájában. Elülső. Microbiol. 11: 859. doi: 10.3389/fmicb.2020.00859

Beérkezett: 2020. február 23.; Elfogadva: 2020. április 09 .;
Publikálva: 2020. május 07.

Javier Carballo, Vigo Egyetem, Spanyolország

Guiping Guan, Hunan Mezőgazdasági Egyetem, Kína
Tarique Hussain, Nukleáris Mezőgazdasági és Biológiai Intézet, Pakisztán

† Ezek a szerzők egyformán járultak hozzá ehhez a munkához