Mikroorganizmusok szabad teljes szöveges profilozása az orális mikrobiom és az elhízottak plazma biokémiája szempontjából
Spearman korrelációs elemzését alkalmaztuk a plazma biokémiai profiljának és demográfiai jellemzőinek páros elemzéséhez. A p-értékek többszöri összehasonlításához Benjamini – Hochberg hamis felfedezési arányt (FDR) alkalmaztunk. A színintenzitás a korreláció erősségét mutatja. Az egyes mezők csillagai a javított p-értéket jelzik; *** ≤ 0,001, ** ≤ 0,01 és * ≤ 0,05. Az elemzéseket az RStudio 3.5.0 verziójú corrplot csomag segítségével hajtottuk végre.
Alfa-diverzitás elemzés 28 153 szekvenálási mélységen a megfigyelt_OTU-k, a hit_PD és a Shannon indexeknél.
Béta változatosság-elemzés 3D-s főkoordináták (PCoA) grafikonon a súlyozott_unifrac, a súlyozatlan_unifrac és a Bray Curtis indexeknél.
A mikrobiom taxonómiai eloszlása menedék, család és faj szintjén. Az egyes oszlopok magassága az adott filotípus relatív arányát képviseli. Csak a legalább 0,5% -os relatív arányú mikrobákat mutatjuk be a sávokon. A Kruskal – Wallis teszt nem mutat különbséget (p ≤ 0,05) a vizsgálati csoportok között.
Oszlopdiagram a Firmicutes/Bacteroidetes arány és a Fusobacteriumok becsült átlagainak a kontroll és az elhízott csoportokban a trigliceridek, az inzulin és a HBA1c beállítása után. Az adatokat átlagként (95% CI) mutatjuk be.
Oszlopdiagram a Firmicutes/Bacteroidetes arány és a Fusobacteriumok becsült átlagainak a kontroll és az elhízott csoportokban a trigliceridek, az inzulin és a HBA1c beállítása után. Az adatokat átlagként (95% CI) mutatjuk be.
Spearman-féle korrelációs elemzés a bakteriális törzs és a demográfiai/plazma biokémiai értékek között. A színintenzitás jelzi a korreláció erősségét, amelyet r-értékként ábrázolnak. Az elemzéseket az RStudio 3.5.0 verziójú corrplot csomag segítségével hajtottuk végre. Az egyes mezők csillagai a javított p-értéket jelzik; ** ≤ 0,01 és * ≤ 0,05.
Absztrakt
Spearman korrelációs elemzését alkalmaztuk a plazma biokémiai profiljának és demográfiai jellemzőinek páros elemzéséhez. A p-értékek többszöri összehasonlításához Benjamini – Hochberg hamis felfedezési arányt (FDR) alkalmaztunk. A színintenzitás a korreláció erősségét mutatja. Az egyes mezők csillagai a javított p-értéket jelzik; *** ≤ 0,001, ** ≤ 0,01 és * ≤ 0,05. Az elemzéseket az RStudio 3.5.0 verziójú corrplot csomag segítségével hajtottuk végre.
Alfa-diverzitás elemzés 28 153 szekvenálási mélységen a megfigyelt_OTU-k, a hit_PD és a Shannon indexeknél.
Béta változatosság-elemzés 3D-s főkoordináták (PCoA) grafikonon a súlyozott_unifrac, a súlyozatlan_unifrac és a Bray Curtis indexeknél.
A mikrobiom taxonómiai eloszlása menedék, család és faj szintjén. Az egyes oszlopok magassága az adott filotípus relatív arányát képviseli. Csak a legalább 0,5% -os relatív arányú mikrobákat mutatjuk be a sávokon. A Kruskal – Wallis teszt nem mutat különbséget (p ≤ 0,05) a vizsgálati csoportok között.
Oszlopdiagram a Firmicutes/Bacteroidetes arány és a Fusobacteriumok becsült átlagainak a kontroll és az elhízott csoportokban a trigliceridek, az inzulin és a HBA1c beállítása után. Az adatokat átlagként (95% CI) mutatjuk be.
Oszlopdiagram a Firmicutes/Bacteroidetes arány és a Fusobacteriumok becsült átlagainak a kontroll és az elhízott csoportokban a trigliceridek, az inzulin és a HBA1c beállítása után. Az adatokat átlagként (95% CI) mutatjuk be.
Spearman-féle korrelációs elemzés a bakteriális törzs és a demográfiai/plazma biokémiai értékek között. A színintenzitás a korreláció r-értékként ábrázolt erősségét jelzi. Az elemzéseket az RStudio 3.5.0 verziójú corrplot csomag segítségével hajtottuk végre. Az egyes mezők csillagai a javított p-értéket jelzik; ** ≤ 0,01 és * ≤ 0,05.